Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4932414N04RikQ8CEQ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4932414N04RikQ8CEQ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4932414N04RikQ8CEQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4932414N04RikQ8CEQ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4932414N04RikQ8CEQ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms