Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cacnb2Q8CC27 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacnb2Q8CC27 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacnb2Q8CC27 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacnb2Q8CC27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacnb2Q8CC27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms