Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4bp3Q8C7U1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4bp3Q8C7U1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4bp3Q8C7U1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4bp3Q8C7U1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4bp3Q8C7U1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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