Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppm1mQ8BU27 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppm1mQ8BU27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppm1mQ8BU27 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppm1mQ8BU27 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppm1mQ8BU27 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppm1mQ8BU27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms