Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe23Q8BGW3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Bhlhe23Q8BGW3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe23Q8BGW3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe23Q8BGW3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms