Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGI4

Fam13a, Protein FAM13A, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam13aQ8BGI4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam13aQ8BGI4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam13aQ8BGI4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fam13aQ8BGI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam13aQ8BGI4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam13aQ8BGI4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam13aQ8BGI4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fam13aQ8BGI4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fam13aQ8BGI4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms