Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Npm2Q80W85 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Npm2Q80W85 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Npm2Q80W85 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Npm2Q80W85 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Npm2Q80W85 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Npm2Q80W85 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Npm2Q80W85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Npm2Q80W85 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Npm2Q80W85 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm2Q80W85 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Npm2Q80W85 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Npm2Q80W85 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms