Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nup98Q6PFD9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nup98Q6PFD9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup98Q6PFD9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nup98Q6PFD9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms