Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg2aQ6P4T0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg2aQ6P4T0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg2aQ6P4T0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg2aQ6P4T0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg2aQ6P4T0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg2aQ6P4T0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg2aQ6P4T0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms