Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM3

Tmem130, Transmembrane protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem130Q6NXM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem130Q6NXM3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem130Q6NXM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tmem130Q6NXM3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tmem130Q6NXM3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmem130Q6NXM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem130Q6NXM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem130Q6NXM3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmem130Q6NXM3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem130Q6NXM3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem130Q6NXM3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem130Q6NXM3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem130Q6NXM3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem130Q6NXM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem130Q6NXM3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms