Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3rf1Q69ZI1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3rf1Q69ZI1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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