Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vamp1Q62442 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp1Q62442 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vamp1Q62442 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp1Q62442 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms