Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sall3Q62255 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sall3Q62255 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sall3Q62255 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Sall3Q62255 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sall3Q62255 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Sall3Q62255 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Sall3Q62255 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms