Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW52

Mlip, Muscular LMNA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MlipQ5FW52 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MlipQ5FW52 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MlipQ5FW52 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MlipQ5FW52 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MlipQ5FW52 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MlipQ5FW52 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms