Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930596D02RikQ3V0H9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms