Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrch2Q3UMG5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrch2Q3UMG5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrch2Q3UMG5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.7 ms