Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFB2

Znhit6, Box C/D snoRNA protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit6Q3UFB2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znhit6Q3UFB2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Znhit6Q3UFB2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znhit6Q3UFB2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znhit6Q3UFB2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znhit6Q3UFB2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znhit6Q3UFB2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znhit6Q3UFB2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znhit6Q3UFB2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znhit6Q3UFB2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 669.7 ms