Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTH7

1500011B03Rik, RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500011B03RikQ3TTH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1500011B03RikQ3TTH7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1500011B03RikQ3TTH7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms