Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam172aQ3TNH5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam172aQ3TNH5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam172aQ3TNH5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam172aQ3TNH5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam172aQ3TNH5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms