Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf3c3Q3TMP1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf3c3Q3TMP1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gtf3c3Q3TMP1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms