Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB82

Plekhf1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhf1Q3TB82 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Plekhf1Q3TB82 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Plekhf1Q3TB82 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Plekhf1Q3TB82 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhf1Q3TB82 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhf1Q3TB82 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhf1Q3TB82 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhf1Q3TB82 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhf1Q3TB82 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhf1Q3TB82 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhf1Q3TB82 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhf1Q3TB82 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhf1Q3TB82 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms