Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd11Q1RNF8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd11Q1RNF8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Samd11Q1RNF8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Samd11Q1RNF8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms