Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smpd1Q04519 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smpd1Q04519 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smpd1Q04519 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smpd1Q04519 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smpd1Q04519 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smpd1Q04519 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd1Q04519 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms