Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcqQ02111 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkcqQ02111 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrkcqQ02111 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcqQ02111 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms