Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HmgcrQ01237 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HmgcrQ01237 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HmgcrQ01237 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HmgcrQ01237 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms