Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Apba2P98084 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Apba2P98084 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Apba2P98084 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apba2P98084 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Apba2P98084 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apba2P98084 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Apba2P98084 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Apba2P98084 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Apba2P98084 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Apba2P98084 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apba2P98084 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Apba2P98084 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Apba2P98084 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apba2P98084 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apba2P98084 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Apba2P98084 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Apba2P98084 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms