Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxb13P70321 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxb13P70321 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb13P70321 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxb13P70321 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb13P70321 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms