Protein–RNA interactions for Protein: P58929

Gmeb2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gmeb2P58929 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms