Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cyp2c40P56657 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cyp2c40P56657 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cyp2c40P56657 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cyp2c40P56657 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cyp2c40P56657 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cyp2c40P56657 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp2c40P56657 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms