Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YCR049CYCR049C 447 nt7.63□□□□□ -1.19
VFA1P40080 RTC4YNL254C 1206 nt7.63□□□□□ -1.19
VFA1P40080 YPR127WYPR127W 1038 nt7.63□□□□□ -1.19
VFA1P40080 HPT1YDR399W 666 nt7.62□□□□□ -1.19
VFA1P40080 PIH1YHR034C 1035 nt7.62□□□□□ -1.19
VFA1P40080 CTF3YLR381W 2202 nt7.62□□□□□ -1.19
VFA1P40080 NFS1YCL017C 1494 nt7.62□□□□□ -1.19
VFA1P40080 MHP1YJL042W 4197 nt7.61□□□□□ -1.19
VFA1P40080 SNT309YPR101W 528 nt7.61□□□□□ -1.19
VFA1P40080 GAL2YLR081W 1725 nt7.61□□□□□ -1.19
VFA1P40080 MLS1YNL117W 1665 nt7.6□□□□□ -1.19
VFA1P40080 EDC2YER035W 438 nt7.6□□□□□ -1.19
VFA1P40080 DTR1YBR180W 1719 nt7.6□□□□□ -1.19
VFA1P40080 TDP1YBR223C 1635 nt7.6□□□□□ -1.19
VFA1P40080 URH1YDR400W 1023 nt7.59□□□□□ -1.19
VFA1P40080 LCP5YER127W 1074 nt7.59□□□□□ -1.19
VFA1P40080 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.59□□□□□ -1.19
VFA1P40080 PAC10YGR078C 600 nt7.59□□□□□ -1.19
VFA1P40080 DLD1YDL174C 1764 nt7.59□□□□□ -1.2
VFA1P40080 CEM1YER061C 1329 nt7.58□□□□□ -1.2
VFA1P40080 PDA1YER178W 1263 nt7.58□□□□□ -1.2
VFA1P40080 MIX17YMR002W 471 nt7.58□□□□□ -1.2
VFA1P40080 MPE1YKL059C 1326 nt7.57□□□□□ -1.2
VFA1P40080 YPQ2YDR352W 954 nt7.57□□□□□ -1.2
VFA1P40080 HHY1YEL059W 309 nt7.57□□□□□ -1.2
VFA1P40080 CYS3YAL012W 1185 nt7.57□□□□□ -1.2
VFA1P40080 YPL067CYPL067C 597 nt7.57□□□□□ -1.2
VFA1P40080 ARO7YPR060C 771 nt7.57□□□□□ -1.2
VFA1P40080 YPR130CYPR130C 408 nt7.57□□□□□ -1.2
VFA1P40080 MSG5YNL053W 1470 nt7.56□□□□□ -1.2
VFA1P40080 KDX1YKL161C 1302 nt7.56□□□□□ -1.2
VFA1P40080 DML1YMR211W 1428 nt7.56□□□□□ -1.2
VFA1P40080 CBK1YNL161W 2271 nt7.56□□□□□ -1.2
VFA1P40080 MTR3YGR158C 753 nt7.56□□□□□ -1.2
VFA1P40080 MBF1YOR298C-A 456 nt7.56□□□□□ -1.2
VFA1P40080 PLB2YMR006C 2121 nt7.55□□□□□ -1.2
VFA1P40080 SRF1YDL133W 1314 nt7.55□□□□□ -1.2
VFA1P40080 TUB1YML085C 1344 nt7.55□□□□□ -1.2
VFA1P40080 AMN1YBR158W 1650 nt7.55□□□□□ -1.2
VFA1P40080 TRR2YHR106W 1029 nt7.55□□□□□ -1.2
VFA1P40080 PUS5YLR165C 765 nt7.55□□□□□ -1.2
VFA1P40080 YPQ1YOL092W 927 nt7.55□□□□□ -1.2
VFA1P40080 ERS1YCR075C 783 nt7.54□□□□□ -1.2
VFA1P40080 YAL045CYAL045C 309 nt7.54□□□□□ -1.2
VFA1P40080 YML079WYML079W 606 nt7.54□□□□□ -1.2
VFA1P40080 YBL111CYBL111C 2004 nt7.54□□□□□ -1.2
VFA1P40080 ILV2YMR108W 2064 nt7.53□□□□□ -1.2
VFA1P40080 MRPL28YDR462W 444 nt7.53□□□□□ -1.2
VFA1P40080 PTH2YBL057C 627 nt7.52□□□□□ -1.21
VFA1P40080 ARC35YNR035C 1029 nt7.52□□□□□ -1.21
VFA1P40080 GET4YOR164C 939 nt7.52□□□□□ -1.21
VFA1P40080 snR30snR30 606 nt7.52□□□□□ -1.21
VFA1P40080 BRN1YBL097W 2265 nt7.52□□□□□ -1.21
VFA1P40080 PPS1YBR276C 2424 nt7.51□□□□□ -1.21
VFA1P40080 MCH2YKL221W 1422 nt7.51□□□□□ -1.21
VFA1P40080 IDP3YNL009W 1263 nt7.5□□□□□ -1.21
VFA1P40080 PRS4YBL068W 981 nt7.5□□□□□ -1.21
VFA1P40080 YOL099CYOL099C 492 nt7.5□□□□□ -1.21
VFA1P40080 CYB2YML054C 1776 nt7.5□□□□□ -1.21
VFA1P40080 SEC23YPR181C 2307 nt7.5□□□□□ -1.21
VFA1P40080 NAF1YNL124W 1479 nt7.49□□□□□ -1.21
VFA1P40080 EFM1YHL039W 1758 nt7.49□□□□□ -1.21
VFA1P40080 CIA1YDR267C 993 nt7.49□□□□□ -1.21
VFA1P40080 FHN1YGR131W 525 nt7.49□□□□□ -1.21
VFA1P40080 CST26YBR042C 1194 nt7.49□□□□□ -1.21
VFA1P40080 ATG22YCL038C 1587 nt7.49□□□□□ -1.21
VFA1P40080 YBR241CYBR241C 1467 nt7.49□□□□□ -1.21
VFA1P40080 KIN1YDR122W 3195 nt7.49□□□□□ -1.21
VFA1P40080 TOM71YHR117W 1920 nt7.48□□□□□ -1.21
VFA1P40080 AFG2YLR397C 2343 nt7.48□□□□□ -1.21
VFA1P40080 TUF1YOR187W 1314 nt7.48□□□□□ -1.21
VFA1P40080 YNL040WYNL040W 1371 nt7.47□□□□□ -1.21
VFA1P40080 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.47□□□□□ -1.21
VFA1P40080 MGM101YJR144W 810 nt7.47□□□□□ -1.21
VFA1P40080 CCT3YJL014W 1605 nt7.46□□□□□ -1.21
VFA1P40080 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.46□□□□□ -1.22
VFA1P40080 NTG1YAL015C 1200 nt7.46□□□□□ -1.22
VFA1P40080 NTG2YOL043C 1143 nt7.46□□□□□ -1.22
VFA1P40080 YCL049CYCL049C 939 nt7.46□□□□□ -1.22
VFA1P40080 PUP2YGR253C 783 nt7.45□□□□□ -1.22
VFA1P40080 YNR005CYNR005C 405 nt7.45□□□□□ -1.22
VFA1P40080 HBN1YCL026C-B 582 nt7.45□□□□□ -1.22
VFA1P40080 GPH1YPR160W 2709 nt7.45□□□□□ -1.22
VFA1P40080 GSH1YJL101C 2037 nt7.45□□□□□ -1.22
VFA1P40080 TAH11YJR046W 1815 nt7.45□□□□□ -1.22
VFA1P40080 REC107YJR021C 945 nt7.44□□□□□ -1.22
VFA1P40080 HTZ1YOL012C 405 nt7.44□□□□□ -1.22
VFA1P40080 YIL108WYIL108W 2091 nt7.43□□□□□ -1.22
VFA1P40080 PAC2YER007W 1557 nt7.43□□□□□ -1.22
VFA1P40080 RPL2BYIL018W 765 nt7.43□□□□□ -1.22
VFA1P40080 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.43□□□□□ -1.22
VFA1P40080 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.43□□□□□ -1.22
VFA1P40080 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.43□□□□□ -1.22
VFA1P40080 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.43□□□□□ -1.22
VFA1P40080 FCP1YMR277W 2199 nt7.42□□□□□ -1.22
VFA1P40080 YIP4YGL198W 708 nt7.42□□□□□ -1.22
VFA1P40080 RPL31BYLR406C 342 nt7.42□□□□□ -1.22
VFA1P40080 SPG5YMR191W 1122 nt7.42□□□□□ -1.22
VFA1P40080 RGD2YFL047W 2145 nt7.41□□□□□ -1.22
VFA1P40080 CBR1YIL043C 855 nt7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms