Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh15P33146 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdh15P33146 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdh15P33146 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdh15P33146 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms