Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kif3aP28741 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kif3aP28741 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3aP28741 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3aP28741 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms