Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LoxP28301 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LoxP28301 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LoxP28301 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LoxP28301 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LoxP28301 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LoxP28301 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LoxP28301 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LoxP28301 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LoxP28301 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LoxP28301 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LoxP28301 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LoxP28301 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LoxP28301 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LoxP28301 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LoxP28301 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LoxP28301 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LoxP28301 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LoxP28301 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LoxP28301 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LoxP28301 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LoxP28301 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LoxP28301 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LoxP28301 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LoxP28301 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LoxP28301 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LoxP28301 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LoxP28301 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LoxP28301 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LoxP28301 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LoxP28301 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LoxP28301 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LoxP28301 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LoxP28301 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LoxP28301 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LoxP28301 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LoxP28301 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LoxP28301 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LoxP28301 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LoxP28301 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LoxP28301 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LoxP28301 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LoxP28301 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LoxP28301 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LoxP28301 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LoxP28301 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LoxP28301 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LoxP28301 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LoxP28301 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LoxP28301 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LoxP28301 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LoxP28301 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LoxP28301 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LoxP28301 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LoxP28301 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LoxP28301 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LoxP28301 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LoxP28301 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LoxP28301 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LoxP28301 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LoxP28301 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LoxP28301 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LoxP28301 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LoxP28301 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LoxP28301 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LoxP28301 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LoxP28301 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LoxP28301 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LoxP28301 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LoxP28301 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LoxP28301 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LoxP28301 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LoxP28301 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LoxP28301 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LoxP28301 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LoxP28301 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LoxP28301 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LoxP28301 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LoxP28301 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LoxP28301 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LoxP28301 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LoxP28301 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LoxP28301 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LoxP28301 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LoxP28301 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LoxP28301 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LoxP28301 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LoxP28301 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LoxP28301 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LoxP28301 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LoxP28301 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LoxP28301 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LoxP28301 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LoxP28301 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LoxP28301 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LoxP28301 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LoxP28301 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LoxP28301 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LoxP28301 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LoxP28301 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms