Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb9P28076 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmb9P28076 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmb9P28076 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb9P28076 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmb9P28076 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psmb9P28076 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psmb9P28076 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psmb9P28076 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb9P28076 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb9P28076 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb9P28076 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb9P28076 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmb9P28076 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb9P28076 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb9P28076 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb9P28076 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb9P28076 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Psmb9P28076 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb9P28076 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb9P28076 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb9P28076 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb9P28076 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb9P28076 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Psmb9P28076 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb9P28076 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb9P28076 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb9P28076 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb9P28076 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb9P28076 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Psmb9P28076 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms