Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna1P26231 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna1P26231 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna1P26231 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna1P26231 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms