Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-D1P14427 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-D1P14427 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-D1P14427 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-D1P14427 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms