Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrgnP13609 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrgnP13609 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrgnP13609 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrgnP13609 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrgnP13609 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SrgnP13609 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrgnP13609 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrgnP13609 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SrgnP13609 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrgnP13609 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SrgnP13609 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SrgnP13609 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms