Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolP10400 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP10400 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP10400 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP10400 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP10400 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP10400 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP10400 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP10400 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP10400 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP10400 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP10400 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolP10400 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP10400 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP10400 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolP10400 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP10400 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP10400 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP10400 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP10400 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP10400 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP10400 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP10400 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP10400 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP10400 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP10400 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP10400 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP10400 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP10400 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP10400 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP10400 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP10400 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP10400 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP10400 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP10400 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP10400 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP10400 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP10400 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP10400 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP10400 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP10400 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP10400 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP10400 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP10400 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP10400 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP10400 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PolP10400 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolP10400 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolP10400 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolP10400 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolP10400 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolP10400 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolP10400 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolP10400 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PolP10400 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PolP10400 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms