Protein–RNA interactions for Protein: O89010

Magea6, MCG114343, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea6O89010 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Magea6O89010 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Magea6O89010 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Magea6O89010 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Magea6O89010 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Magea6O89010 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Magea6O89010 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Magea6O89010 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Magea6O89010 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Magea6O89010 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Magea6O89010 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Magea6O89010 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Magea6O89010 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Magea6O89010 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Magea6O89010 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Magea6O89010 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Magea6O89010 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Magea6O89010 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Magea6O89010 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Magea6O89010 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Magea6O89010 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Magea6O89010 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Magea6O89010 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Magea6O89010 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Magea6O89010 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Magea6O89010 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Magea6O89010 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms