Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpd52l1O54818 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpd52l1O54818 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpd52l1O54818 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpd52l1O54818 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpd52l1O54818 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpd52l1O54818 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpd52l1O54818 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms