Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Klrk1O54709 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Klrk1O54709 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Klrk1O54709 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Klrk1O54709 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Klrk1O54709 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Klrk1O54709 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms