Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnfrsf18O35714 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf18O35714 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf18O35714 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfrsf18O35714 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfrsf18O35714 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms