Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KeraO35367 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KeraO35367 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KeraO35367 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KeraO35367 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KeraO35367 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KeraO35367 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KeraO35367 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KeraO35367 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KeraO35367 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KeraO35367 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KeraO35367 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KeraO35367 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KeraO35367 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KeraO35367 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KeraO35367 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KeraO35367 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KeraO35367 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KeraO35367 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KeraO35367 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KeraO35367 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KeraO35367 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KeraO35367 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KeraO35367 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KeraO35367 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KeraO35367 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KeraO35367 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KeraO35367 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KeraO35367 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KeraO35367 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KeraO35367 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KeraO35367 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KeraO35367 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KeraO35367 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KeraO35367 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KeraO35367 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KeraO35367 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KeraO35367 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KeraO35367 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KeraO35367 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KeraO35367 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KeraO35367 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KeraO35367 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KeraO35367 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KeraO35367 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KeraO35367 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KeraO35367 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KeraO35367 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KeraO35367 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KeraO35367 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KeraO35367 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KeraO35367 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KeraO35367 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KeraO35367 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KeraO35367 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
KeraO35367 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KeraO35367 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KeraO35367 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KeraO35367 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
KeraO35367 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KeraO35367 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KeraO35367 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KeraO35367 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KeraO35367 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KeraO35367 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KeraO35367 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KeraO35367 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KeraO35367 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KeraO35367 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KeraO35367 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KeraO35367 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KeraO35367 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KeraO35367 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KeraO35367 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KeraO35367 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KeraO35367 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KeraO35367 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KeraO35367 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KeraO35367 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KeraO35367 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KeraO35367 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KeraO35367 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KeraO35367 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KeraO35367 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KeraO35367 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KeraO35367 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KeraO35367 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KeraO35367 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KeraO35367 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KeraO35367 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms