Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurod4O09105 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurod4O09105 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod4O09105 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod4O09105 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 345.2 ms