Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2888K7N746 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2888K7N746 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm2888K7N746 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm2888K7N746 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2888K7N746 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms