Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4930544D05RikJ3QK56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930544D05RikJ3QK56 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4930544D05RikJ3QK56 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4930544D05RikJ3QK56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms