Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Obox6G3X9U1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Obox6G3X9U1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Obox6G3X9U1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Obox6G3X9U1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Obox6G3X9U1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Obox6G3X9U1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Obox6G3X9U1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Obox6G3X9U1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox6G3X9U1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox6G3X9U1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox6G3X9U1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox6G3X9U1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Obox6G3X9U1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms