Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Arfgef1G3X9K3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Arfgef1G3X9K3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Arfgef1G3X9K3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Arfgef1G3X9K3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arfgef1G3X9K3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms