Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7S8

Vmn2r22, Vomeronasal 2, receptor 22, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r22E9Q7S8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r22E9Q7S8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r22E9Q7S8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r22E9Q7S8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r22E9Q7S8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms