Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc144bE9PVZ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc144bE9PVZ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc144bE9PVZ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms